¡Batalla en la Frontera, las instalaciones a la vanguardia de los combates Pokémon! Emerald intenta conquistar todas las instalaciones de la Frontera, pero sus combates contra los Cerebros están llenos de altibajos. Por otro lado, una sombra misteriosa hace aparición…¡Su objetivo es la elusiva estrella de los deseos que despierta una vez cada mil años!